Los animales acuáticos se pueden clasificar en varios grupos, incluyendo peces, mamíferos marinos, reptiles, anfibios, invertebrados como moluscos, crustáceos, equinodermos y cnidarios, entre otros. También se pueden distinguir por su tipo de respiración (branquial o pulmonar) y por su hábitat dentro del agua, como organismos planctónicos, nectónicos o bentónicos. 

Grupos principales de animales acuáticos: 

Peces:

Son el grupo más diverso y conocido, con especies óseas y cartilaginosas. 

Mamíferos marinos:

Incluyen ballenas, delfines, focas, morsas, entre otros, que respiran por pulmones y pasan gran parte de su vida en el agua. 

Reptiles:

Algunas tortugas marinas, serpientes marinas y cocodrilos viven en ambientes acuáticos. 

Anfibios:

Las ranas, salamandras y otros anfibios tienen fases larvarias acuáticas, y algunos adultos también pueden ser acuáticos.